Gabe, tras matar a Shin Hao (líder de la rebelión del ejército Chino) en Tokio, es llamado para acudir al senado de Washington D. C. por un comité del senado que investiga la alarma del Syphon Filter.

Mientras los diversos agentes de la agencia de Gabe van testificando ante un tribunal, Gabe y Lian  se encargan de acabar con el Syphon Filter. Pero lo que no saben es que el tribunal está yendo en su contra...